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关键词 |
说 明 |
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allele |
相关的个体或菌株含有相同基因的稳定的其它形式，该形式区别于这一位置的现有的序列(和或许其它序列) |
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attenuator |
存在调节转录的终止的DNA区域，它控制了一些细菌操纵子的表达；位于启动子和第一个结构基因之间，引起转录的部分终止的序列区段 |
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C_region |
免疫球蛋白轻和重链的恒定区，和T-细胞受体α，β，和γ链；根据特定的链可包括一个或多个外显子 |
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CAAT_signal |
CAAT盒；位于可能参与RNA聚合酶结合的真核生物转录单位的起始点的75bp上游的保守序列的一部分；共有序列=GG(C或T)CAATCT |
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CDS |
编码序列；对应于蛋白质中的氨基酸序列的核苷酸的序列(位置包括终止密码子)；特征包括氨基酸概念上的翻译 |
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conflict |
在这一位点或区域，单独确定的“相同”序列有所不同 |
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D-loop |
置换环；线粒体DNA内的一个区域，其中RNA的短的序列与DNA的一条链配对，代替了这一区域的原始配对DNA链；也用于说明在RecA蛋白质催化的反应中，侵入的单链替代双链DNA的一条链的区域 |
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D-segment |
免疫球蛋白重链的多变区，和T-细胞受体的β链 |
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enhancer |
顺式-作用序列，它增强了(一些)真核生物启动子的作用，并能在任一方向和与启动子相关的任何位置处(上游或下游)起作用 |
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exon |
编码剪接mRNA部分的基因组区域；可以含有5'UTR，所有CDS，和3'UTR |
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GC_signal |
GC盒；位于真核生物转录单位起始点上游的保守的富含GC区域，可以以多重拷贝 或任一方向存在；共有序列=GGGCGG |
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gene |
鉴定为基因的生物学意义的区域，并已经指定名称 |
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iDNA |
间插DNA；通过几种重组中的任何一种能被消除的DNA |
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intron |
被转录的DNA区段，但通过同时剪接位于其两侧的序列(外显子)即可从转录本内部将其除去 |
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J_segment |
免疫球蛋白轻链和重链的连接区段，和T-细胞受体α，β和γ链 |
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LTR |
长的末端重复，在确定序列的两端直接重复的序列，类型典型地见于逆转录病毒中 |
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mat_peptide |
成熟的肽或蛋白质的编码序列；翻译后修饰之后成熟的或最终的肽或蛋白质产物的编码序列；位置不包括终止密码子(与相应的CDS不同) |
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misc_binding |
不能用任何其它Binding关键词(primer_bind或protein_bind)表述的与另一个组成成分共价或非-共价结合的核酸中的位点 |
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misc_difference |
特征序列与记载中存在的有所不同，并且不能用任何其它不同关键词(conflict，unsure，old_sequence，mutation，variation，allele或modified_base)表述 |
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misc_feature |
不能用任何其它的特征关键词表述的具有生物学意义的区域；新的或少见的特征 |
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misc_recomb |
任何一般性的，位点特异性的或复制的重组事件的位点，该位点中有不能用其它重组关键词(iDNA和virion)或来源关键词的修饰词(/insertion_seq，/transposon，/proviral)表述的双螺旋DNA的断裂和愈合 |
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misc_RNA |
不能用其他RNA关键词(prim_transcript，precursor_RNA，mRNA，5'clip，3'clip，5'UTR，3'UTR，exon，CDS，sig_peptide，transit_peptide，mat_peptide，intron，polyA_site，rRNA，tRNA，scRNA和snRNA)限定的任何转录本或RNA产物 |
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misc_signal |
含有控制或改变基因功能或表达之信号的任何区域，所述信号不能用其他Signal关键词(promoter，CAAT_signal，TATA_signal，-35_signal，-10_signal，GC_signal，RBS，polyA_signal，enhancer，attenuator，terminator，和rep_origin)表述 |
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misc_structure |
不能用其他Structure关键词(stem_loop和D-loop)表述的任何二级或三级结构或构象 |
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modified_base |
被指示的核苷酸是经修饰的核苷酸，并应由被指示的分子(在mod_base修饰词意义中给出)所取代 |
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mRNA |
信使RNA；包括5'非翻译区(5'UTR)，编码序列(CDS，外显子)和3'非翻译区(3'UTR) |
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mutation |
在此位置处，相关品系的序列中具有突发的，可遗传的变化 |
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N_region |
在重排的免疫球蛋白区段之间插入的额外的核苷酸 |
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old_sequence |
在此位置处，所表述的序列修改了此序列以前的版本 |
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polyA_signal |
聚腺苷酸化之后内切核酸酶裂解RNA转录本所必需的识别区域；共有序列=AATAAA |
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polyA_site |
RNA转录本上的位点，通过转录后聚腺苷酸化该位点将被加上腺嘌呤残基 |
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precursor_RNA |
仍不是成熟的RNA产物的任何RNA种类；可包括5'剪切区(5'clip)，5'非翻译区(5'UTR)，编码序列(CDS，外显子)，间插序列(内含子)，3'非翻译区(3'UTR)，和3'剪切区(3'clip) |
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prim_transcript |
初级(最初的，未加工的)转录本；包括5'剪切区(5'clip)，5'非翻译区(5'UTR)，编码序列(CDS，外显子)，间插序列(内含子)，3'非翻译区(3'UTR)和3'剪切区(3'clip) |
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primer_bind |
起始复制，转录或逆转录的非－共价的引物结合位点；包括合成的例如PCR引物元件的位点 |
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promoter |
参与RNA聚合酶的结合以启动转录的DNA分子区域 |
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protein_bind |
核酸上非－共价的蛋白质结合位点 |
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RBS |
核糖体结合位点 |
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repeat_region |
含有重复单位的基因组区域 |
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repeat_unit |
单个重复元件 |
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rep_origin |
复制起点；复制核酸以得到两个相同拷贝的起始位点 |
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rRNA |
成熟的核糖体RNA；将氨基酸装配成蛋白质的核糖核蛋白颗粒(核糖体)中的RNA成份 |
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S_region |
免疫球蛋白重链的开关区；它参与重链DNA的重排，导致来自相同B－细胞的不同免疫球蛋白类的表达 |
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satellite |
短的基本重复单位的很多串联重复(相同或相关的)；大多数具有的碱基组成或其它性质与基因组的一般水平不同，这使得它们与大部分(主带)的基因组DNA分离开来 |
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scRNA |
小的细胞质RNA；几个小的细胞质RNA分子中的任何一个存在于真核生物的细胞质和(有时)核中 |
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sig_peptide |
信号肽编码序列；被分泌的蛋白质的N－末端结构域的编码序列；此结构域涉及新生多肽与膜的结合；前导序列 |
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snRNA |
小的核RNA；很多小的RNA种类中的任何一个都被局限于核中；几个snRNA参与剪接或其它RNA加工反应 |
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source |
鉴定序列中特定范围的生物来源；此关键词是强制性的；每一项至少要有一个跨越整个序列的单一来源关键词；每个序列可允许有一个以上的来源关键词 |
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stem_loop |
发卡结构；由RNA或DNA单链的相邻(反向)互补序列之间的碱基一配对形成的双螺旋区域 |
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STS |
序列标记位点：表述基因组上作图界标并能通过PCR检测的短的，单拷贝DNA序列；通过测定STS系列的次序即可作出图谱的基因组区域 |
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TATA_signal |
TATA盒；Goldberg-Hogness盒；在每个真核生物RNA聚合酶Ⅱ转录单位起点前约25bp处发现的保守的富含AT的七聚体，它可能涉及使酶定位以正确地起始；共有序列=TATA(A或T)A(A或T) |
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terminator |
或者位于转录本的末端或者与启动子区域相邻的DNA序列，该序列可导致RNA聚合酶终止转录；也可以是阻抑蛋白的结合位点 |
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transit_peptide |
转运肽编码序列；核编码的细胞器蛋白质N-末端结构域的编码序列；此结构域参与将蛋白质翻译后运送到细胞器中 |
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tRNA |
成熟的转移RNA，小的RNA分子(75－85个碱基长)，介导核酸序列翻译成氨基酸序列 |
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unsure |
作者不能确定此区域的准确序列 |
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V_region |
免疫球蛋白轻链和重链的可变区，和T－细胞受体α，β和γ链；编码可变的氨基末端部分；可由V_segment，D_segment，N_region和J_segment组成 |
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V_segment |
免疫球蛋白轻链和重链的可变区段，和T-细胞受体α，β和γ链；编码大多数可变区(v_region)和前导肽的最后几个氨基酸 |
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variation |
含有来自相同基因的稳定突变的相关系列(例如RFLP，多态性等)，在此(和可能其它)位置处所述相同基因与被表述的不同 |
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3’clip |
在加工过程中被切下的前体转录本3'端大部分区域 |
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3’UTR |
不被翻译成蛋白质的成熟转录本的3'末端区域(终止密码子之后) |
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5’clip |
在加工过程中被切下的前体转录本5'端大部分区域 |
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5’UTR |
不被翻译成蛋白质的成熟转录本的5'末端区域(起始密码子之前) |
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-10_signal |
Pribnow盒；细菌转录单位起点上游约10bp处的保守区域，它可能参与结合RNA聚合酶；共有序列=TatAaT |
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-35_signal |
细菌转录单位起点上游约35bp处的保守六聚体；共有序列=TTGACa[]或TGTTGACA[] |
中国协会新闻